• provoditi znanstvene, istraživačke i aktivnosti zaštite prirode i okoliša, a u provedbi posebnu pozornost posvetiti interdisciplinarnosti te uključivanju opće populacije kroz tzv. „građansku znanost“
• provoditi edukacijske projekte i programe s posebnim naglaskom na programe cjeloživotnog učenja, rad s djecom i mladima, osjetljivim skupinama u društvu, osobama starije životne dobi te učenicima i studentima
• razvijati i primjenjivati nove, multidisciplinarne i interdisciplinarne istraživačke metode i pristupe upravljanju morskim okolišem i vrednovanja usluga morskog ekosustava
• sakupljati i razmjenjivati informacije o (morskoj) fauni, flori i stanju okoliša
• samostalno ili u suradnji osnivati centre (muzeje, centre znanja i izvrsnosti) za istraživanje i obrazovanje o morskom okolišu i organizmima te centre za oporavak morskih organizama
• razvijati i provoditi projekte valorizacije i očuvanja baštine (materijalne i nematerijalne) vezane uz prirodu s ciljem uključivanja u održivu turističku ponudu i očuvanja kulturnog identiteta
• davati stručna mišljenja i izrađivati studije vezane uz morske organizme i morski okoliš, te zaštitu mora
• promovirati i poticati izvrsnost u svim svojim djelatnostima
• promovirati participativni pristup u odlučivanju, organiziranju i provođenju aktivnosti vezanih uz planiranje i korištenje prirodnih resursa i okoliša
• osigurati javnosti pristup informacijama o temama vezanim uz aktivnosti Instituta, očuvanje i zaštitu prirode i okoliša i održivi razvitak
• pružati stručnu potporu i informacije gospodarskim subjektima i javnoj upravi s ciljem razvoja gospodarskih aktivnosti koje se temelje na principima održivosti
• zagovarati za učinkovito provođenje zaštite i očuvanja prirode i okoliša te održivi razvoj
• organizirati i uključivati se u mreže organizacija koje provode slične programe te uspostavljati suradnju sa stručnjacima i organizacijama
• širiti znanje i informacije vezane za istraživanje i zaštitu morskih organizama i okoliša te povezanosti ljudskog zdravlja i dobrobiti sa zdravljem okoliša i uslugama koje ekosustav pruža putem tiskanih i elektronskih publikacija, izložbi, radionica, skupova, tečajeva, tribina, istraživačkih i edukacijskih programa, stručnog osposobljavanja, organizacije vježbeničkih aktivnosti, snimanje dokumentarnih filmova i sl.
• promovirati volontiranje i uključivanje najšire javnosti u zaštitarske i istraživačke programe i projekte
• surađivati sa tijelima uprave, institucijama, organizacijama, sporazumima itd. te fizičkim i pravnim osobama koje dijele jednake ciljeve kao i Institut,
• razvijati aplikacije za raznovrsne platforme (Internet preglednici, pametni uređaji, računala…) kojima će se građani uključiti u prikupljanje i razmjenu podataka o vrstama i okolišu
• izdavati tiskane i elektroničke publikacije, knjige, radne bilježnice, glasila, brošure, nosače podataka i slično
• izrađivati suvenire koji podižu interes i svijest javnosti o okolišu i biljnim i životinjskim vrstama
• provoditi i druge zakonom dopuštene aktivnosti kojima se promoviraju, zastupaju i ostvaruju temeljne ideje i ciljevi Instituta
ili 
