* -Obavljanje svih poslova u vezi s davanjem koncescija za državne linije: raspisivanje javnog natječaja, donošenje odluka o davanju i oduzimanju koncesije, sklapanje ugovora o koncesiji, poništavanje javnog natječaja, prijenos koncesije na drugog brodara,
* -davanje odobrenja za zamjenski brod u slučaju više sile ili koji ne ispunjava uvjete, produženje koncesije u slučaju ponavljanja javnog natječaja, davanje suglasnosti na cjenik usluga, davanje suglasnosti na red plovidbe,
* -Davanje prethodne suglasnosti na odluke županijskih, općinskih i gradskih poglavarstava o županijskim, međužupanijskim i lokalnim linijama,
* -Utvrđivanje sezonskog i izvansezonskog razdoblja plovidbe
* -Objedinjavanje redova plovidbe
* -Nadziranje provedbe odredaba Zakona i ugovora o koncesiji, u odnosu na potpore i plaćanje naknade za koncesije za državne linije
* -Ostali poslovi koji su Zakonom povjereni Agenciji
ili 
