* -prati i nadzire provođenje Pravila ljekarničke etiek i deontologije i dobre prakse u ljekarničkoj djelatnosti i poduzima odgovarajuće mjere u slučaju njihovog kršenja
* -daje stručna mišljenja i sudjeluje kod pripreme propisa iz područja ljekarničke djelatnosti i ostalih propisa koji utječu na obavljanje ljekarničke djelatnosti
* -daje prijedlog plana potrebnih magistara farmacije ministru nadležnom za zdravstvo
* -sudjeluje pri utvrđivanju standarda i normativa ljekarničkih usluga
* -pruža zaštitu građanima u ostvarivanju prava s obzirom na kakvoću, sadržaj i vrstu ljekrničke usluge koja im se pruža
* -organizira dodatno usavršavanje za proširenje djelatnosti unutar struke s obzirom na nove metode ljekarništva
* -organizira trajno stručno usavršavanje za magistre farmacije i provodi provjeru stručnosti
* -zastupa interese svojih članova kod sklapanja ugovora sa Hrvatskim zavodom za zdravstveno osiguranje i drugim osiguravateljima
* -propisuje način oglašavanja i način isticanja naziva privatne prakse
* -utvrđuje način oblikovanja maloprodajnih cijena lijekova i drugih sredstava koji nisu predmet ugovoranja sa Hrvatskim zavodom za zdravstveno osiguranje
* -obavlja izdavačku djelatnost
* -daje suglasnost na oblikovanje cijena lijekova i drugih sredstava iz dobrovoljnog osiguranja koje određuje ugovorom društvo za osiguranje
* -daje prethodno mišljenje na akt Hrvatskog zavoda za zdravstveno osiguranje kojim se utvrđuje način provođenja plana i programa mjera zdravstvne zaštite, formiranja cijena zdravstvene zaštite i drugih osnova za sklapanje ugovora sa zdravstvenim ustanovama i privatnim zdravstvenim djelatnicama koji čine mrežu zdravstvene djelatnosti
* -brine za pravnu pomoć svojim članovima
* -brine o materijalnim i drugim interesima svojih članova
* -koordinira odnose među članovima te sudjeluje u rješavanju eventualno nastalih sporova
* -u cilju zaštite ugleda magistara farmacije i ljekarništva, reagira na neopravdane i neutemeljene izjave u sredstvima javnog priopćavanja
* -u skladu sa zakonom daje prethodno mišljenje na provedbene propisa koje donosi ministar nadležan za zdravstvo
* -u skladu sa zakonom daje prijedloge provedbenih propisa koje donosi ministar nadležan za zdravstvo
* -putem web stranice Komore, putem svojeg glasila ili drugim putem obavještava članove Komore u skladu sa člankom 2. stavkom 4. Statuta
* -uključuje se i suurađuje u radu drugih strukovnih organizacija u zemlji i inozemstvu
* -obavlja i druge poslove uređene Zakonom, Statutom i općim aktima Komore
ili 
